生物信息在线可视化
分析网站工具大合集
Hiplot:一个免费和全面的生物信息学
科学计算和可视化云平台
网址:https://hiplot.com.cn/home/index.html
简介:
Hiplot(https://hiplot.com.cn)允许用户方便地以交互方式完成一些以前只能由高级生物信息学或生物统计学研究人员执行的专业可视化任务。其配备的240+生物医学数据可视化功能涵盖了生物医学研究人员的大部分日常需求,涉及基础统计、多组学、回归、聚类、降维、元分析、生存分析、风险建模等。
主要功能模块介绍:
绘图工具:包括柱状图,热图、主成分分析、矩阵气泡图、火山图、韦恩图、Go气泡图、Hi-C热图、弦图、小提琴图、世界/中国地图等常用功能。
微生信云平台(以下简称平台)(http://www.bioinformatics.com.cn)以在线作图、在线数据分析为基本方式,致力于0代码分析科研数据,0代码展示数据结果,帮助生命科学、医学等领域的科研工作者更便捷地分析数据,了解数据,挖掘数据背后的生物医学意义,辅助科研,促进知识传播。
临床统计工具:包括三线表以及一些临床指标计算功能。
数据分析模块:包括:富集分析,差异分析,回归分析等生物信息常用的一些分析方法。
ImageGP:面向科研人员的易于使用
的数据可视化网络服务器
网址:http://www.ehbio.com/ImageGP/
简介:ImageGP 可以在线生成常见的线图、柱状图、散点图、箱线图、集合图、热图和直方图等。用户只要粘贴进去数据矩阵,就可以快速出图。同时 ImageGP 还支持火山图、富集分析泡泡图、主成分分析类图等 和 4 种微生物领域的功能预测和生物标志物鉴定分析,包括 FAPROTAX, Bugbase, PICRUSt 和 LEFSe。在满足方便易用的同时, ImageGP 也提供了灵活性,可以设置常见参数、调整样式,输出发表质量的图。
ChiPlot
网址:https://www.chiplot.online/
简介:
操作非常方便,无需注册,图表类型丰富且有示例数据,可个性化定制自己的图表,还在b站更新视频教学:https://space.bilibili.com/30493771/dynamic。
但是小编无法查到该工具的出处,如有了解麻烦告知小编,谢谢大家。
The R Graph Gallery
网址:https://www.r-graph-gallery.com/
简介:该网站不仅可以绘制分布图,相关性图,排序图,比例图,演化图等各种图形,而且还展示了图形代码。
公司开发的生信画图工具
可以完成部分生信分析和可视化工作,可能需要开通会员或者个别分析工具收费等。
1. 微生信
网址:http://www.bioinformatics.com.cn/
2. 仙桃学术
网址:https://www.xiantao.love/products
3. Bioladder
网址:https://www.bioladder.cn/web/#/pro/index
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